Des mesures hygiéniques telles que nettoyer les paupières à l'eau propre ou à l'aide d'une solution isotonique, se laver fréquemment les mains, éviter de se frotter les yeux et utiliser des serviettes propres et individuelles sont importantes pour la guérison et pour réduire le risque d'extension de l'infection à l'autre œil et à la famille$​​.

• Aucune différence nette en efficacité n'a été démontrée entre les différents antibiotiques locaux$​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​. Avec un traitement antibiotique on peut diminuer la durée moyenne des symptomes (5 jours) avec un jour et demi​​​$​​​​​​​​​​​​​​​​​$​​​​​​​​​​​​​​​​​. Dans les études, les complications ne se produisent pas plus fréquemment dans les groupes sous placebo​​​​$​​​​​​​​​​​​​​​​​.
• Si l'on opte pour la prescription d'un antibiotique, une ordonnance différée semble être une bonne stratégie : demande au patient d'attendre 3 jours avant de commencer le traitement (dans une RCT effectué en première ligne 50% des patients ont commencé le traitement par antibiotique)$​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​​.
• L'acide fusidique n'est plus un traitement de premier choix étant donné qu'une conjonctivite bactérienne est causée par une bactérie résistante à l'acide fusidique en 80 % des cas$​​​​​​​​​​​​​.
• Un orgelet ne ne nécessite pas de traitement antibiotiques et se guérit spontanément en quelques jours.  Si un orgelet se montre persistant après deux semaines, un traitement antibiotique à base de collyre ou de pommade peut être prescrit $​​​​​​​​​​​.   

La spécialité monocomposée à base de chloramphenicol a été retirée en août 2017.  Nous sélectionnons la chlorétracycline (ordonnance différée).  En première ligne, la gentamycine ou la tobramycine ne sont pas un premier choix, ceux-ci sont réservés aux infections par pseudomonas aeruginosa  $​​​​​​​​​.